这几日，素问不只是与太子鸿雁传书。她大部分的时间都在依照段宏写下的病症研究医治的药方。其实，凭借治疗MARS的经验，素问不难找到治疗时疫的良方，只可惜古代医疗资源太匮乏。在研究克制MARS病毒的时候，她采用中西结合的方法，在药方中用了些西药，比如阿司匹林。可在这古代哪里会有西药呢？
就在素问钻研药方的时候，时疫开始蔓延，并且宫中已经有人不治而亡了。由于死亡宫人的尸体被抬出宫后没有得到及时处置，病毒迅速扩散。这样长安城的部分百姓也感染上了时疫。一时间家家闭户，人人自危。
素问派小福子传话给太子，务必将因时疫死亡之人的遗体用火焚烧。太子一直钦佩素问医术精湛，虽觉得焚烧遗体的做法有些不妥，但仍听从了素问的建议。
但古人一直以为人死之后应入土为安，这种灰飞烟灭的做法，实难接受。因此，太子推行火葬，竟遭到百姓的奋起抗争。
一时间，长安城乱做了一锅粥。
素问深知现在唯有尽快研究出药方根除时疫才能安定民心。
毕竟中医学博士的证书不是山寨的。她竟想出了用醋柳酸加热萃取再冷却的方法，析出了白色的结晶，这便是阿司匹林的雏形了。在此基础上，素问又加了几味中药便制成了治疗时疫的良药。为保万无一失，素问竟先自己服用，以观药效。反复确定之后，才派人将药送入宫中。
段宏拿到素问研制出的药后有些惊诧。他知道这小女儿从小便熟读医书，在自己的悉心教导下也颇通医术。但没想到她竟能研制出治疗时疫之方。尤其是这萃取之术，不知她是从何处学来的。
段宏先在几个感染时疫的宫人身上试了药。这几个宫人竟痊愈了。于是，他便大胆地给皇上用药。由于皇上的病情控制得及时并没有太严重的症状，用药两天后便康复了。
段宏命太医署上下连夜大批量生产治疗时疫的良药，分发给了感染的宫人和百姓。半月后，长安城这一场灭顶之灾便算安然度过了。百姓们皆称赞段太医医术高明。只有段宏心知肚明，真正治愈时疫的是素问。
本来时疫已得到控制，且皇帝也安然无恙，段宏该回家休养了。但几日过去了，素问仍不见父亲回家。段夫人也十分焦急，不知发生了何事。
素问只得趁小福子送信时托他寻问太子。第二天，小福子便带回了消息。
原来是因为娴妃娘娘。娴妃尽管用了素问研制出的药，但因一开始没得到及时的治疗，一直病情危重，不见好转。而娴妃又深得皇上宠爱。见爱妃生命垂危，皇上龙颜大怒，竟说如果娴妃殒命要整个太医署陪葬。
“这皇上也太不讲道理了！爹整治时疫挽救了整个长安城，理应论功行赏的。可现在却因为个妃子命悬一线！”素问气得直拍桌子，暗自感叹还是民主法治的和谐社会好啊。
段夫人忙制止她：“素问，皇上乃九五之尊，岂容你出言不逊？”
说完，段夫人竟有些疑惑——素问一向柔弱，今日却说出如此刚烈之言，想必是担忧父亲吧。
小福子见夫人和素问皆面露担忧之色，赶忙宽慰道：“夫人、二小姐，请放宽心。太子殿下说了，定会竭尽全力保段大人平安。”
段夫人手捻一串佛珠，轻声念了句：“阿弥陀佛。”
段家上下皆惶恐不安。段夫人派了家丁想法设法打探宫中消息。
翌日中午，打探消息的家丁跌跌撞撞跑了进来。
“夫人、夫人，大事不好了！娴妃娘娘歿了！”
随着家丁的一声大叫，段夫人瘫倒在了太师椅上。
灵枢、素问闻声也从闺房中出来，见到面如土色的段夫人也知道事情的严重性。
素问扶住段夫人，安慰道：“娘，且放宽心，还有太子殿下呢。”
段夫人怔怔地看着素问：“对，太子殿下会向皇上求情的。”
灵枢也在一旁附和道：“对，太子殿下对素问一往情深，定会力保爹爹的。”
正在三人相互安慰之际，小福子满头大汗地跑了进来。
“夫人，二小姐！不好了，不好了！”小福子边跑边喊，声音都变调了。
段夫人脸色惨白，瘫坐在太师椅上瑟瑟发抖。
“小福子，出什么事了？”素问强作镇定问道。
小福子趴在地上，气喘吁吁地说：“娴妃娘娘殁了，皇上龙颜大怒要太医署全体太医陪葬。段太医与皇上争辩，情急之下竟出言不逊，大骂皇上‘昏君’。皇上大怒赐段家满门抄斩。此时御林军已经往府上来了。”
小福子话音未落，段夫人已不省人事。
灵枢颤抖着问道：“那、那太子殿下呢？有没有为爹求情？”
小福子叹了口气：“太子殿下再三为段大人求情，但皇上盛怒之下根本不听。殿下竟以死相逼，最后被禁了足。”
素问心中一颤——太子殿下对以前的素问果真情深义重，只可惜有缘无份了。
这时，府门已经被撞开，十几个御林军冲了进来……
看着爹娘人头落地，素问心中也是十分悲恸。虽然只与他们相处一月有余，但他们确是对自己百般疼爱。且段家这满门抄斩确实冤枉，自己也为他们鸣不平……
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